В начале вооруженного конфликта стороны традиционно обвинили друг друга, а формальным поводом для нового обострения стало перекрытие таджикскими военнослужащими автомобильной дороги, соединяющей киргизские города Исфару и Баткен. Этот участок автодороги из-за причудливо извивающейся границы проходит по таджикской территории. После боестолкновения стороны заявили о перемирии и возобновлении движения по автодороге. Однако в любой момент можно ожидать нового конфликта между Таджикистаном и Киргизией: значительная часть их общей тысячекилометровой границы не демаркирована и множество участков близ границы обе стороны считают своими.
В апреле 2021 года между Киргизией и Таджикистаном едва не началась война из-за столба на границе. Таджики решили установить на столбе линии электропередачи камеры видеонаблюдения. Представители киргизской стороны сочли, что столб стоит на их территории, и вознамерились спилить его вместе с камерами. Спор перешел в стадию, когда спорящие принялись закидывать друг друга камнями, что, в свою очередь, переросло в бои на границе с использованием тяжелых вооружений. А отряд специального назначения «Бору» Погранслужбы Госкомитета нацбезопасности Кыргызской республики перешел в наступление, захватил и уничтожил здание пограничной заставы «Ходжа Аълло» Республики Таджикистан. В ходе конфликта погибло более трех десятков человек и около трехсот получили ранения. Новый вооруженный конфликт едва не вспыхнул в начале июня, после того как военные Таджикистана установили контейнер на спорном участке границы и на автомобильной и легкобронированной технике на километр углубились на территорию Ошской области Киргизии.
При этом нельзя считать происходящие события делом Таджикистана и Киргизии. Во-первых, обе страны являются членами ОДКБ и поставят организацию в странное положение, если начнут между собой полномасштабный военный конфликт. Генсек ОДКБ Станислав Зась призвал немедленно прекратить огонь и предложил Душанбе и Бишкеку помощь в разрешении конфликта. А во-вторых, эти страны соседствуют с Афганистаном, где к власти пришли талибы, скептически относящиеся к светским правительствам Киргизии и Таджикистана. Если в войне за несколько квадратных километров Бишкек и Душанбе ослабят друг друга, а население разочаруется в своих правительствах, никто не сможет удержать часть афганских узбеков (около 2 млн) и афганских таджиков (около 12 млн) от того, чтобы попытаться «помочь» своим этническим братьям в установлении другого порядка.
